Universitetet fick bara 4 av 23 möjliga poäng och hamnade näst sist av de 185 myndigheterna som har rankats.
Direktören Staffan Sarbäck är dock inte förvånad över placeringen.
Fjolårets internrevisionsrapport visade nämligen på stora brister i universitets miljöledningsarbetet.
– Det var svidande kritik, säger han till tidningen Universitetsläraren och tillägger:
– Vi var på gränsen till att leva upp till lagstiftningen om miljöledning. De fyra poängen från Naturvårdsverket är ett kvitto på att internrevisionens slutsatser var korrekta. Den största bristen är systematiken. Vi jobbar inte på det sätt vi ska med miljöledningssystem.
Sedan dess har man dock gjort en utredning och skjutit till mer resurser.
Målsättningen är att nästa år vara den myndighet som klättrat mest i rankningen.