Felix Rhodin 2, Arad Esmaili, Tim Lindfors och Felix Lundberg gjorde Skellefteå FF:s mål, medan Guilliendrick Jowensley Gideon Kierindongo, Björn Robert Jan Schaap och Cedric Ssejemba stod för gästernas målgörande.
Boden City har startat svagt och är helt utan poäng efter tre spelade matcher. Skellefteå FF har sex poäng.
Nästa motstånd för Boden City är Bergnäset. Lagen möts lördag 3 maj 15.00 på Björknäsvallen.