Kampen om JVM-guldet stod mellan Strömnäsåkaren Sofia Henriksson och Natalia Nepryaeva, Ryssland.
Men Norrbottens längskidlöfte fick se sig slagen av ryskan med retsamma 2,7 sekunder.
Trea blev Anastasia Sedova från Ryssland som var 10,9 sekunder bakom Henriksson.
Under måndagen har svenskan en ny chans till medalj i stafetten som avslutar mästerskapet i italienska Val di Fiemme. I fredags blev Strömnäsåkaren elva i skiathlon.